摘要 1. 迫切需要大規模植物資料來提高我們對群落組裝、共存、生物地理學、演化和許多其他基本生物過程的理

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• 類型：已發表論文
• 日期：2022-09-02

摘要

1. 迫切需要大規模植物資料來提高我們對群落組裝、共存、生物地理學、演化和許多其他基本生物過程的理解。了解這些過程對於預測和處理人類與生物多樣性的相互作用以及全球變遷動態（例如糧食和能源安全、生態系統服務、氣候變遷和物種入侵）至關重要。 2. 植物資訊與生態網絡 (BIEN) 資料庫包含空前豐富的經過清理和標準化的植物數據，包含約 8,100 萬條距今約 8,100 萬筆發生記錄。 375,000 種，c.來自 c. 的 28 個性狀的 915,000 個性狀觀察。來自全球 110,000 個生態地塊的 93,000 個物種和共現記錄，以及新世界物種的 100,000 個範圍圖和 100 個複製的系統發育圖（每個包含 81,274 個物種）。在這裡，我們描述了一個 R 包，可以輕鬆存取這些資料。 3. BIEN R套件允許使用者存取BIEN資料庫中的多種類型的資料。此套件中的函數透過將使用者輸入轉換為最佳化的 PostgreSQL 函數來查詢 BIEN 資料庫。函數名稱遵循約定，旨在使每個函數的功能易於理解。我們還開發了一個協議，為透過 BIEN R 套件下載的數據提供客製化的引文和植物標本館致謝。 4. BIEN資料庫的發展代表了生物資料整合、清洗和標準化的重大成就。同樣，BIEN R 套件代表了開放科學的重要工具，它使每個人都可以免費、輕鬆地存取 BIEN 資料庫。