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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
2002 年，義大利西西里島首次檢測到柑橘 tristeza 病毒 (CTV) 爆發。為了深入了解驅動這些 CTV 族群出現的演化力量和系統發育地理學，我們測定並分析了 2002 年至 2009 年收集的 108 個 CTV 分離株的 p20 基因的核苷酸序列。貝葉斯系統發育分析顯示，輕度和重度 CTV 分離株屬於 5 個不同的類別。 2002年，進化枝（譜系）被引進西西里島。系統發育地理分析表明，四個譜系在位於西西里島東部的主要柑橘種植區共同循環。然而，只有一個譜系（由溫和的分離株組成）傳播到西西里島的遙遠地區，並在 2007 年後被檢測到。沒有發現遺傳變異與柑橘宿主之間的相關性，顯示柑橘品種沒有對病毒施加差異選擇壓力。 CTV的遺傳變異不是根據地理位置或採樣時間來建構的，這可能是由於多次引入事件和複雜的遷移模式以及同一地區不同譜系的強烈共同和再循環所致。系統發育結構、中性統計檢定以及同義和非同義替代率的比較表明，快速擴張後的弱負選擇和遺傳漂變可能是今天在西西里島觀察到的 CTV 變異的主要原因。儘管如此，p20 N 端區域的三個相鄰氨基酸被發現處於正選擇之下，這可能是適應事件造成的。