摘要 DNA 甲基化是脊椎動物基因調控的重要且豐富的機制

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• 類型：已發表論文
• 日期：2022-09-02

摘要

DNA 甲基化是脊椎動物基因調控的重要且豐富的機制。它在許多其他後生動物中不太常見，並且在一些關鍵模型物種中完全不存在，例如蠅和秀麗隱桿線蟲。我們在此報告了一項關於 138 種蛻皮動物中是否存在 DNA 甲基轉移酶 (DNMT) 的綜合研究，涵蓋節肢動物、線蟲動物、節肢動物、有爪動物和緩步動物。其中三個門之前尚未研究過 DNA 甲基化的存在。我們觀察到單一 DNMT 的缺失在蛻皮動物門中多次獨立發生。我們使用高斯混合模型 MethMod 的實現，根據編碼序列中的 CpG 速率，透過計算預測 DNA 甲基化的存在。綜合這兩項分析，我們預測蛻皮動物中存在兩種先前未知的 DNA 甲基化缺失，一種是在螯肢動物中，另一種是在緩步動物中。在早期分枝的 Ecdysozoa Priapulus caudatus 中，我們預測存在全套 DNMT 和 DNA 甲基化。因此，我們展示了不同蛻皮動物門中 DNA 甲基化的非常多樣化和獨立的進化，跨越了 7 億多年的系統發育範圍。