本頁只刊出中文翻譯與中文說明；英文原文請見下方原文連結。
原文連結
論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
HIV-1 中的重組已有充分記錄，但其在宿主內多樣化的低多樣性環境中的重要性卻鮮為人知。在這裡，我們開發了一種新型計算工具（RAPR（重組分析程序）），可以詳細了解早期感染期間的體內病毒重組，並將其應用於來自縱向樣本的近全長 HIV-1 基因組序列。重組基因組迅速取代傳播/創始 (T/F) 譜系，中位半衰期為 27 天，增加了病毒群的遺傳複雜性。我們確定了與亞型間重組體中觀察到的重組熱點和冷點不同的重組熱點和冷點。此外，對來自具有明確中和抗體反應的個體的縱向樣本進行 RAPR 分析表明，重組有助於在多樣化的準種中延續賦予抗性的突變。這些發現提供了對病毒重組導致 HIV-1 持久性和免疫發病機制的分子機制的深入了解，並對 HIV 體內傳播和進化的研究具有重要意義。