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論文資訊
- 類型:已發表論文
- 日期:2022-09-02
摘要
MicroRNA (miRNA) 是一組類似 21 nt 長的小型核糖調節因子,在轉錄後層級抑制基因表現。它們最獨特的結構特徵是其前體 pre-miRNA 的折返髮夾。儘管 miRBase 中存放的每個 pre-miRNA 的二級結構都已預測,但人們對 pre-miRNA 之間的結構保守模式知之甚少。我們透過使用 FOLDALIGN 基於成對、序列和二級結構比對對人類 pre-miRNA 序列進行聚類來解決這個問題,然後透過 WAR 對獲得的簇進行全局多重比對。結果,成功確定了四個 FOLDALIGN 簇的共同二級結構:Rfam 資料庫的 RF00027 結構家族和具有先前未描述的共識結構的三個簇。