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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
MicroRNA 在轉錄後基因調控中扮演重要角色。然而，關於 microRNA 失調影響的資訊主要依賴潛在標靶的生物資訊預測，而大多缺乏直接物理 microRNA/標靶信使 RNA 交互作用的證據。在國際癌症基因組聯盟計畫「透過定序確定惡性淋巴瘤的分子機制」中，我們對 16 例伯基特淋巴瘤、19 例瀰漫性大 B 細胞淋巴瘤和 21 例濾泡性淋巴瘤進行了 miRnome 定序。 22 種 miRNA 將伯基特淋巴瘤與瀰漫性大 B 細胞淋巴瘤/濾泡性淋巴瘤區分開來，其中 13 種已顯示出受到 MYC 的調節。此外，我們發現了三種迄今為止未報導的 microRNA 的表達。此外，我們在瀰漫性大B細胞淋巴瘤和濾泡性淋巴瘤中檢測到hsa-miR-142的反覆突變，以及hsa-miR-376簇的編輯，為淋巴瘤發生中的microRNA編輯提供了證據。為了探討 microRNA 與信使 RNA 的直接物理交互作用，我們進行了 Argonaute-2 光活化核糖核苷增強交聯和免疫沉澱實驗。 MicroRNA直接靶向伯基特淋巴瘤模型中的208個信使RNA和非伯基特淋巴瘤模型中的328個信使RNA。這項綜合分析發現了與淋巴瘤發生相關的幾種調控途徑，包括 Ras、PI3K-Akt 和 MAPK 訊號傳導途徑，這些途徑也經常因突變而在淋巴瘤中失調。我們的數據集表明，透過 microRNA 解除信使 RNA 的調節是淋巴瘤發生中高度相關的機制。