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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
RNA 成熟的許多方面都會以與參考基因組 DNA 的偏差的形式在 RNA 定序數據中留下痕跡。這尤其包括基因組非編碼核苷酸和化學修飾。後者以不匹配和顯著的測序讀數模式的形式留下了自己的簽名。專注於特定類型偏差的修改繪圖程序可以幫助解開轉錄後修飾、成熟和降解過程。在這裡，我們將重點放在大量產生的小 RNA 定序數據，旨在分析 microRNA 表現。從 tRNA 中許多眾所周知的修飾位點的恢復開始，我們提供了證據表明修飾核苷酸是這些資料集中的普遍現象。關於非編碼核苷酸，我們關注 CCA 尾部，令人驚訝的是，CCA 尾部可以在包括成熟 microRNA 亞群在內的多種轉錄物集合中找到。儘管單獨的小型 RNA 定序文庫不足以獲得完整的圖片，但它們可以提供有關 RNA 成熟複雜過程的許多方面的資訊。