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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
RNA病毒巨大的進化潛力使它們能夠在宿主防禦機制存在的情況下蓬勃發展，並賦予它們出現、宿主轉換和毒力等特性。感染過程後突變病毒的頻率是由病毒複製酶的錯誤率、異常 RNA 轉錄後作用的純化機制以及病毒 RNA 正鏈 (+) 和負鏈 (-) 的擴增動力學之間的相互作用造成的。描述病毒RNA擴增的兩種極端情況是幾何增長，其中每條RNA鏈作為模板以相同的效率合成互補鏈，以及沖壓機，其中一條鏈反覆用作模板來合成互補鏈的多個副本。產生的突變頻率完全不同，幾何成長比沖壓機更具誘變性。在這項工作中，我們評估了幾何生長和沖壓機對植物 (+)-鏈 RNA 病毒蕪菁花葉病毒 (TuMV) 整體基因組擴增的貢獻。透過TuMV cDNA感染性克隆對本塞姆氏菸草原生質體的轉染實驗，並使用鏈特異性定量即時PCR，我們確定了單細胞感染過程中病毒（+）和（-）RNA的擴增動態。將描述每個病毒鏈擴增的數學模型與數據進行擬合。模型參數分析表明，TuMV (+) 和 (-) RNA 擴增是透過混合策略發生，與透過沖壓機產生的基因組相似，93% 相似，而幾何增長產生的基因組僅相似 7%。