摘要 SARS CoV 2 感染的一個關鍵問題是為什麼病毒量和患者結果因人而異

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• 類型：已發表論文
• 日期：2022-09-02

摘要

SARS-CoV-2 感染的一個關鍵問題是為什麼病毒量和患者結果因人而異。由於病毒傳播和免疫反應的時空動力學在體內研究具有挑戰性，我們開發了冠狀病毒空間免疫模型（SIMCoV），這是一種可擴展的計算模型，可以模擬數億個肺細胞，包括呼吸道上皮細胞和 T 細胞。 SIMCoV 複製了在患者中觀察到的病毒生長動態，並表明空間分散的感染會導致病毒量增加。該模型顯示了 T 細胞反應的時間和強度如何影響病毒的持久性、振盪和控制。透過整合空間交互作用，SIMCoV 透過僅改變初始感染部位的數量以及 T 細胞免疫反應的強度和時間，為患者之間顯著不同的病毒量軌跡提供了簡約的解釋。當分支氣道結構被明確表示時，我們發現病毒比在 2D 上皮細胞層中傳播得更快，但比在未分化的 3D 網格或充分混合的 ODE 模型中慢得多。這些結果說明了現實的空間明確計算模型如何提高對 SARS-CoV-2 感染的宿主內部動態的理解。