本頁只刊出中文翻譯與中文說明；英文原文請見下方原文連結。
原文連結
論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
不斷進化的基因型網絡可以透過流感病毒等病原體的全球時間分辨基因分型來建構。這種基因型網絡是相鄰頂點（病毒株）在單一核苷酸或胺基酸上不同的圖。豐富的網絡分析方法可以幫助理解這些網絡結構所反映的演化動態。在這裡，我分析了一個包含數百個甲型流感 (H3N2) 血凝素基因的基因型網絡。這個網絡充滿了反映非隨機並行或收斂（同質）進化的循環。這些循環也顯示出強烈的局部進化約束、正向選擇和突變限制進化的序列變化特徵模式。這種循環在系統發育樹上是看不見的，這說明基因型網路分析可以補充系統發育分析。該網絡還顯示出獨特的模組或群落結構，該結構反映了病毒株的時間接近性而非空間接近性，其中連接程度較低的橋接毒株連接不同的模組。這些和其他組織模式表明，基因型網絡可以幫助我們以前所未有的分辨率水平研究行動中的演化。