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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
人類 APOBEC3 蛋白是胞苷脫氨酶，透過控制外源性逆轉錄病毒複製和內源性逆轉錄元件逆轉錄轉座，廣泛促進先天免疫。作為一種內在的抗逆轉錄病毒防禦機制，APOBEC3 蛋白誘導廣泛的鳥苷到腺苷 (G-to-A) 突變，並抑制新生人類免疫缺陷病毒 1 型 (HIV-1) cDNA 的合成。此外，人類 APOBEC3 蛋白也被提議誘導罕見的、潛在非致命的 G 至 A 突變，這些突變對病毒基因組的序列多樣化和透過獲得有益突變進行適應做出了微妙的貢獻。利用培養物中的單週期 HIV-1 感染和高度並行的 DNA 定序，我們定義了 APOBEC3D、APOBEC3F、APOBEC3G 和 APOBEC3H 編輯位點的三核苷酸背景。然後，我們將這些 APOBEC3 編輯環境與從 10 名原發性 HIV-1 感染患者中連續獲得的細胞中 HIV-1 DNA 的 G 到 A 突變模式進行了比較。在 APOBEC3 脫氨酶編輯位點的首選三核苷酸環境中，病毒替換最高。與免疫選擇的影響一致，位於人類白血球抗原 (HLA) 適當表位內的 APOBEC3 編輯環境中累積的氨基酸變化，已知或預測這些表位能夠實現勝肽結合。因此，APOBEC3 活性可能會誘導突變，影響自然感染中 HIV-1 群體的遺傳多樣性和適應。