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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
人類免疫缺陷病毒（HIV）的黏膜傳播導致病毒遺傳多樣性的瓶頸。 Gnanakaran 及其同事使用計算策略來識別包膜中特定位置的特徵氨基酸，這些氨基酸與感染早期採樣的傳播序列或慢性感染期間採樣的序列相關。觀察到的最強烈的特徵是在傳播和早期感染時第 12 位組氨酸穩定存在的富集，以及在慢性感染中第 12 位組氨酸的反覆丟失。該氨基酸位於包膜的前導肽內，該蛋白質的一個區域已被證明可以影響包膜糖蛋白的表達和病毒粒子的感染性。我們發現，與具有非鹼性12位殘基的病毒相比，傳播/創始病毒中12位帶正電荷的氨基酸（如組氨酸）與新生包膜多肽更有效地運輸到內質網以及更高的穩態糖蛋白表達之間存在很強的相關性，這種取代在從慢性感染個體中取樣的病毒中豐富。當在其他病毒蛋白中表現時，具有鹼性氨基酸位置 12 的傳遞包膜以更高的密度摻入病毒中，並且比非特徵包膜表現出更高的感染滴度。這些結果支持使用計算方法檢查大型病毒序列資料集的功能特徵的潛在效用，並表明包膜表達量對於有效 HIV 傳播的重要性。