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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
人類微生物組代表了一個極其複雜的生態系統，與許多宿主相關過程緊密相連，直接影響人類健康。然而，迄今為止，大多數研究都集中在表徵健康和疾病中微生物組的組成以及比較分析，而相對較少的努力是將微生物組作為一個綜合的綜合生物系統進行研究和建模。在本次演講中，我將強調開發微生物組預測系統層級模型的迫切需要，並討論該微生物系統基於宏基因組的建模的潛在計算框架。我將描述在細胞、生態和超有機體層面上建立此類模型的一些初步嘗試，以解釋微生物組中複雜的相互作用網絡。具體來說，我將示範如何使用基於網路和基於約束的模型來研究微生物組的各個方面，預測微生物與微生物以及微生物與宿主的相互作用。這些模型使我們能夠深入了解控制微生物組組裝的力量以及與疾病相關的組織轉變。最後，我將討論整合各種建模方法和多個元組學資料集的途徑，以獲得對微生物組的全面、多尺度、機制的理解，並透過這項研究促進令人興奮的未來臨床應用。