本頁只刊出中文翻譯與中文說明；英文原文請見下方原文連結。
原文連結
論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
人類細胞毒性 T 淋巴細胞 (CTL) 對人類免疫缺陷病毒 1 型 (HIV-1) 的反應已被深入研究，數百個 CTL 表位已通過實驗定義、發表並彙編在 HIV 分子免疫學數據庫中。 HIV-1 蛋白序列上的 CTL 抗原決定位圖譜表明，確定的抗原決定位傾向於聚集。在這裡，我們整合全球序列和免疫學資料庫，系統地探討HIV-1胺基酸序列和CTL表位分佈之間的關係。迄今為止，文獻中已經對五種 HIV-1 蛋白（Gag p17、Gag p24、逆轉錄酶 (RT)、Env 和 Nef）的 CTL 反應進行了詳細描述。透過將這五種蛋白質中的 CTL 抗原決定位分佈與全局蛋白質序列比對進行比較，我們確定了與 CTL 抗原決定位定位相關的 HIV 氨基酸序列的獨特特徵。首先，實驗確定的HIV CTL表位集中在相對保守的區域。其次，缺乏表位的高度可變區域具有過去免疫逃逸的累積證據，這可能使它們相對折射於CTL：預測的蛋白酶體加工位點的缺乏以及不作為C端錨定殘基的氨基酸的富集。最後，CTL 抗原決定位高度集中在蛋白質的 α 螺旋區域。根據氨基酸序列特徵，我們以盲法預測了 HIV 調節蛋白和輔助蛋白中可能含有 CTL 抗原決定位點的區域；然後透過與 HIV-1 Rev、Tat、Vif 和 Vpr 中新的實驗定義表位組進行比較來驗證這些預測。