聖塔非研究所

摘要 儘管已測序和重測序的基因組數量迅速增加,但有關大規模測序數據的計算組裝的許多問題仍未解決

2022-09-02 · 已發表論文 · 更新 2026/03/19 上午03:58

摘要 儘管已測序和重測序的基因組數量迅速增加,但有關大規模測序數據的計算組裝的許多問題仍未解決。計算組裝在大型基因組計劃以及不斷發展的高通量技術中至關重要,並且在處理這些方法產生的資訊中發揮重要作用。在這裡,我們提供了當前公開的序列組裝程序的全面概述。我們描述了計算組裝的基本原理以及主要關注點,例如基因組 DNA 中的重複序列、高表達基因和 EST 序列中的替代轉錄本。我們總結…

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  • 類型:已發表論文
  • 日期:2022-09-02

摘要

儘管已測序和重測序的基因組數量迅速增加,但有關大規模測序數據的計算組裝的許多問題仍未解決。計算組裝在大型基因組計劃以及不斷發展的高通量技術中至關重要,並且在處理這些方法產生的資訊中發揮重要作用。在這裡,我們提供了當前公開的序列組裝程序的全面概述。我們描述了計算組裝的基本原理以及主要關注點,例如基因組 DNA 中的重複序列、高表達基因和 EST 序列中的替代轉錄本。我們總結了不同彙編器的現有比較,並提供了彙編程式下載的詳細描述和說明,網址為: assembly/methods.html。 (c) 2008 Elsevier Ltd. 保留所有權利。