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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
全長傳播的 HIV-1 基因組的鑑定可以透過直接分析那些實際導致有效臨床感染的病毒，從而有助於 HIV-1 發病機制、殺微生物劑和疫苗研究。我們在 12 名急性感染受試者（9 個 B 分支和 3 個 C 分支）中證明，可以透過單基因組擴增和血漿病毒體 RNA 定序來推斷傳播/創始病毒的完整 HIV-1 基因組。這使得能夠對傳播/創始病毒進行分子克隆和生物學分析，並對宿主選擇壓力的綜合作用在進化的病毒準種上留下的遺傳印記進行全面的全基因組評估。傳播的病毒編碼完整的規範基因（gag-pol-vif-vpr-tat-rev-vpu-env-nef），並在原代人CD4（+）T淋巴細胞中有效複製，但在單核細胞衍生的巨噬細胞中複製效率低得多。傳播的病毒是CD4和CCR5向性的，並且表現出包膜橋接片和可變環的輔助受體結合表面的隱藏。感染後3. 2個月，三名受試者中的傳播/創始人病毒幾乎完全被在兩到五個精心選擇的基因組位點上不同的病毒所取代；到 12-20 個月時，病毒在 17-34 個離散位置表現出集中突變。這些發現揭示了與黏膜 HIV-1 傳播相關的病毒特性，以及主要但不完全由早期細胞毒性 T 細胞反應驅動的一組有限的快速進化的適應性突變。