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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
兩個次世代定序平台與詳細的比較 BAC 物理重疊群圖譜的協同組合，提供了一種經濟高效的家養火雞 (Meleagris gallopavo) 基因組序列組裝。定序的源基因組的雜合性允許發現超過 600,000 個高品質的單核苷酸變異。儘管存在這種雜合性，但目前的基因組組裝（類似於 1.1 Gb）包括分配給特定火雞染色體的 917 Mb 序列。註釋識別出近 16,000 個基因，其中 15,093 個被識別為蛋白質編碼基因，611 個被識別為非編碼 RNA 基因。火雞、雞和斑胸草雀基因組的比較分析，以及鳥類與哺乳動物物種的比較，支持了鳥類基因組的特徵穩定性，並鑑定了鳥類譜系獨有的基因。鳥類免疫系統基因的數量和種類有明顯差異，其中擴展和新基因的頻率低於基因缺失的例子。火雞基因組序列為進一步了解脊椎動物基因組的進化和家禽經濟重要數量性狀背後的遺傳變異提供了資源。這種綜合方法可能是提供具有農業、生態和進化意義的其他物種的基因和染色體水平組裝的模型。