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聖塔非研究所

摘要 動機：對哺乳動物、尾索動物和線蟲的結構化 ncRNA 基因進行全基因組篩選，預測了數千個假定的 n

2022-09-02 · 已發表論文 · 更新 2026/03/19 上午04:10

摘要 動機：對哺乳動物、尾索動物和線蟲的結構化 ncRNA 基因進行全基因組篩選，預測了數千個假定的 ncRNA 基因和其他結構化 RNA 基序。其功能註釋的先決條件是高精度地決定閱讀方向。結果：雖然 RNA 及其反向互補體的摺疊能相似，但這些差異至少與取代模式結合起來足以區分結構化 RNA 及其互補體。我們在這裡提出了一種支援向量機，它可以從多序列比對中可靠地對結構化 RNA…

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論文資訊

  • 類型：已發表論文
  • 日期：2022-09-02

摘要

動機：對哺乳動物、尾索動物和線蟲的結構化 ncRNA 基因進行全基因組篩選，預測了數千個假定的 ncRNA 基因和其他結構化 RNA 基序。其功能註釋的先決條件是高精度地決定閱讀方向。結果：雖然 RNA 及其反向互補體的摺疊能相似，但這些差異至少與取代模式結合起來足以區分結構化 RNA 及其互補體。我們在這裡提出了一種支援向量機，它可以從多序列比對中可靠地對結構化 RNA 的閱讀方向進行分類，並且比以前的方法在分類準確性方面提供了相當大的改進。軟體：RNAstrand 可作為獨立工具免費從 獲取，並且還包含在最新版本的 RNAz（維也納 RNA 軟體包的一部分）中。