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聖塔非研究所

摘要 動機：小核仁 RNA (snoRNA) 是一類豐富的非編碼 RNA，具有多種細胞功能，包括 RNA

2022-09-02 · 已發表論文 · 更新 2026/03/19 上午03:48

摘要 動機：小核仁 RNA (snoRNA) 是一類豐富的非編碼 RNA，具有多種細胞功能，包括 RNA 的化學修飾、端粒維護、前 rRNA 加工和選擇性剪接中的調節活動。 Box C/D snoRNA 的主要作用是確定 2' O 核糖甲基化的標靶，這對於 rRNA 成熟和某些 mRNA 的剪接調節非常重要。然而，許多「孤兒」snoRNA 的標靶仍然未知。雖然 box H/AC…

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論文資訊

  • 類型：已發表論文
  • 日期：2022-09-02

摘要

動機：小核仁 RNA (snoRNA) 是一類豐富的非編碼 RNA，具有多種細胞功能，包括 RNA 的化學修飾、端粒維護、前 rRNA 加工和選擇性剪接中的調節活動。 Box C/D snoRNA 的主要作用是確定 2'-O-核糖甲基化的標靶，這對於 rRNA 成熟和某些 mRNA 的剪接調節非常重要。然而，許多「孤兒」snoRNA 的標靶仍然未知。雖然 box H/ACA snoRNA 的快速有效的標靶預測器是可用的，但對於 box C/D snoRNA 不存在類似的工具，即使它們以不太複雜的方式結合到其標靶上。結果：PLEXY 是一​​種動態程式演算法，可計算 box C/D snoRNA 與假定目標 RNA 的熱力學最佳交互作用。 PLEXY 作為大型輸入序列的掃描儀並在雙鏈結構上配備了過濾器，是預測 box C/D snoRNA 標靶位點的高效可靠的工具。