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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
化學反應是化學鍵的重排。因此，離析物分子中的每個原子再次出現在反應產物之一的特定位置。然而，化學反應資料庫並沒有報告離析物和產物原子之間的這種雙射，因此尋找這種雙射的「原子映射問題」成為計算化學和系統生物學中許多實際應用的重要計算任務。基本化學反應具有循環虛過渡態（ITS），它對離析物和產物原子之間的雙射施加了額外的限制，而以前的方法沒有考慮到這一點。我們證明約束編程非常適合解決這種情況下的原子映射問題。我們的方法的性能是針對 KEGG 資料庫中手動策劃的化學反應子集進行評估的，該資料庫具有各種 ITS 循環佈局和反應機制。