摘要 原核生物中的水平基因轉移在短期和中期進化時間尺度上十分猖獗

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• 類型：已發表論文
• 日期：2022-09-02

摘要

原核生物中的水平基因轉移在短期和中期進化時間尺度上十分猖獗。它對我們重建生命演化樹的能力提出了一個根本問題。它在長進化距離中也很常見嗎？為了解決這個問題，我們分析了 438 個完整定序的原核生物基因組中來自所有 20 個主要家族的 2,091 個插入序列的演化。具體來說，我們將插入序列的出現映射到我們分析的基因組的 16S rDNA 樹上，並且我們還構建了插入序列轉座酶編碼序列的系統發育樹。我們只發現 30 例可能在關係較遠的原核進化枝之間發生水平轉移。大多數這些水平轉移事件都是古老的。只有七個事件是最近發生的。幾乎所有這些轉移事件都發生在人類病原體或共生體之間。如果對於其他非移動DNA也是如此，那麼遠距離水平轉移的稀有性增加了從序列資料中進行可靠的系統發育推斷的可能性。