摘要 單細胞 RNA 定序 (scRNA seq) 提供了在細胞層面監測宿主和病原體轉錄組的可能性

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• 類型：已發表論文
• 日期：2022-09-02

摘要

單細胞 RNA 定序 (scRNA-seq) 提供了在細胞層面監測宿主和病原體轉錄組的可能性。在這裡，使用來自果蠅中腸細胞的公共 scRNA-seq 數據集來比較兩種果蠅小核病毒（Thika 病毒（TV）和果蠅諾拉病毒（DMelNV））之間複製策略和細胞反應的差異。與 DMelNV 相比，TV 的病毒 RNA 累積量較低，但感染的細胞數量較多。在這兩種情況下，病毒 RNA 累積會根據細胞亞型而變化。對 TV 和 DMelNV 感染的細胞熱休克反應具有細胞亞型和病毒特異性。系統性反應感染後期瓶頸基因的破壞，以及兩種細胞亞型對 DMelNV 的細胞反應中翻譯相關基因的破壞，可能會影響病毒複製。