聖塔非研究所

摘要 在合成生物學領域,遺傳部分的合理設計應包括對其輸入輸出反應(所謂的傳遞函數)以及如何調整它們的因果

2022-09-02 · 已發表論文 · 更新 2026/03/19 上午03:24

摘要 在合成生物學領域,遺傳部分的合理設計應包括對其輸入輸出反應(所謂的傳遞函數)以及如何調整它們的因果理解。然而,一種普遍採用的策略是將數據擬合到希爾形曲線,而不考慮潛在的分子機制。在這裡,我們提供了一種新穎的數學形式,可以透過考慮所涉及的生物部件的實際資訊來預測合成設備的全局行為。這是透過採用類似酶學的框架來實現的,其中傳遞函數用輸入親和常數和最大響應來描述。作為概念證明,…

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  • 類型:已發表論文
  • 日期:2022-09-02

摘要

在合成生物學領域,遺傳部分的合理設計應包括對其輸入輸出反應(所謂的傳遞函數)以及如何調整它們的因果理解。然而,一種普遍採用的策略是將數據擬合到希爾形曲線,而不考慮潛在的分子機制。在這裡,我們提供了一種新穎的數學形式,可以透過考慮所涉及的生物部件的實際資訊來預測合成設備的全局行為。這是透過採用類似酶學的框架來實現的,其中傳遞函數用輸入親和常數和最大響應來描述。作為概念證明,我們描述了一組具有不同水平的 Lux 受體和信號分子的 Lux 高絲氨酸內酯誘導遺傳裝置。我們的模型符合實驗結果,並預測受體核醣體結合位點強度的影響,作為影響基因表現的可調參數。概述了進化的意義。