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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
在恆定的施加力下扭轉 DNA 揭示了熱激活轉變為具有超螺旋結構（稱為 plectoneme）的狀態。使用過渡態理論，我們預測該 plectoneme 成核速率為 10(4) Hz 量級。我們注意到用於操縱 DNA 的珠子上的黏性阻力限制了測量的速率，將這一點與測量了 10 Hz 數量級的跳躍率的實驗相協調。我們發現鹼基對序列無序引起的固有彎曲對於理解控制轉變的自由能障礙很重要。計算中使用了解析方法和數值方法。我們提供了有關模擬無序和無序彈性桿模型的數值方法的詳細資訊。