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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
在早期的工作中，對人類免疫缺陷病毒 1 型 (HIV-1) 序列進行了分析，以估計 HIV-1 主要群體（導致獲得性免疫缺陷綜合症大流行的病毒）的祖先序列的時間，得出了 1931 年的最佳估計（1915-1941 年的 95% 置信區間）。我們將簡要回顧這項工作，概述如何擴展系統發育工具以納入改進的演化模型，如何調整分子鐘模型以納入可變的潛伏期，以及如何透過正確估計兩個歷史記錄日期的時間來驗證該方法。將總結此方法的優點、限制和假設，特別考慮分支長度不確定性和重組的影響。我們最近對來自剛果民主共和國（剛果民主共和國，以前的紮伊爾）的一組極其多樣化的人類免疫缺陷病毒包膜序列進行了新的系統發育分析。這項分析既證實又擴展了我們最初研究的結論。使用合併方法來推斷剛果民主共和國 HIV-1 流行的人口歷史，結果顯示感染人口隨著時間的推移呈指數增長。