聖塔非研究所

摘要 在本文中,我們考慮具有獨特基因型 表型關係的催化活性物種的演化動力學

2022-09-02 · 已發表論文 · 更新 2026/03/19 上午04:21

摘要 在本文中,我們考慮具有獨特基因型 表型關係的催化活性物種的演化動力學。 RNA 分子的摺疊景觀是這種與基本中性特性關係的範例。景觀本身由表型(實現為 RNA 二級結構)劃分。每個基因型(表示為序列)都以獨特的方式分配一個結構。映射到特定結構的所有序列的集合被建模為序列空間中的隨機圖(所謂的神經網路)。催化網絡被實現為具有最大出度二和二級結構作為頂點集的隨機有向圖。與確定性…

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論文資訊

  • 類型:已發表論文
  • 日期:2022-09-02

摘要

在本文中,我們考慮具有獨特基因型-表型關係的催化活性物種的演化動力學。 RNA 分子的摺疊景觀是這種與基本中性特性關係的範例。景觀本身由表型(實現為 RNA 二級結構)劃分。每個基因型(表示為序列)都以獨特的方式分配一個結構。映射到特定結構的所有序列的集合被建模為序列空間中的隨機圖(所謂的神經網路)。催化網絡被實現為具有最大出度二和二級結構作為頂點集的隨機有向圖。與確定性描述相比,一組催化 RNA 分子表現出顯著不同的行為:超循環能夠共存並在具有卓越催化支持的情況下擊敗寄生蟲。可以觀察到網路的不同動態組織之間的“切換”,可以報告超循環組織針對錯誤的動態穩定性以及催化錯誤閾值的存在。 (C) 2000 年學術出版社。