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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
在每個細菌物種中，不同的菌株可能在它們編碼的基因組或這些基因的拷貝數方面有所不同。然而，人類微生物群的分類學特徵通常僅限於物種層級或先前定序的菌株，因此，物種內變異的普遍性、其功能作用及其與宿主健康的關係仍不清楚。在這裡，我們對腸道微生物組中的物種內拷貝數變異進行了全面的大規模分析，引入了嚴格的計算管道來直接從鳥槍法宏基因組數據中檢測這種變異。我們在許多物種中發現了大量可變基因，並證明這種變異具有重要的功能和臨床相關意義。我們也推斷了物種內的組成概況，確定了族群結構的變化以及尚未表徵的變異的存在。我們的結果強調了微生物組組成和功能能力之間的複雜關係，將宏基因組層級的組成變化與菌株層級的變異聯繫起來。