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論文資訊
- 類型:已發表論文
- 日期:2022-09-02
摘要
在這篇綜述中,我們概述了用於分析後生動物線粒體基因組的各種生物資訊方法和工具。我們比較了可用的專用資料庫,並提出了目前的工具,用於準確的基因組註釋、蛋白質編碼基因的識別以及 tRNA 和 rRNA 模型的確定。我們還使用基於基因順序或序列的數據評估用於系統發育樹推斷的各種工具和模型。對於基於基因順序的方法,我們比較了基於重排和基於基因簇的基因順序重排分析方法。至於基於序列的方法,我們特別強調替代模型或資料處理,以減少後生動物有絲分裂基因組中典型的某些系統偏差,例如基因組內和/或譜系組成異質性之間。