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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
基因本體論 (GO) 為生物學家提供了一個受控術語，描述基因如何與功能相關以及功能術語如何相互關聯。這些術語關係編碼了科學家如何構思生物功能的組織，並且它們採用有向無環圖（DAG）的形式。在這裡，我們建議使用 GO 進行的基因術語註釋的網絡結構可用於建立一種對功能術語進行分組的替代方法，該方法捕獲在 GO DAG 中建立的層次結構中不明顯的內在功能關係。我們的方法不是依賴外部定義的生物功能組織，而是將生物功能連接在一起，如果它們是由相同的基因執行的，如來自許多不同來源的基因註釋數據的概要所示。我們表明，透過這種替代方案對術語進行分組提供了一個新的框架，用於描述和預測實驗確定的基因組的功能。