聖塔非研究所

摘要 基因表現噪音不僅無所不在,而且變化多端,我們仍然不了解影響它的一些最基本的因素

2022-09-02 · 已發表論文 · 更新 2026/03/19 上午12:31

摘要 基因表現噪音不僅無所不在,而且變化多端,我們仍然不了解影響它的一些最基本的因素。其中包括轉錄因子 (TF) 在 DNA 上的停留時間,即與 DNA 結合的 TF 保持結合狀態的平均時間。在這裡,我們使用轉錄調控的隨機模型來研究停留時間如何影響 TF 誘導基因表現時產生的基因表現噪音。我們發現停留時間對基因表現噪音的影響取決於TF的濃度及其與DNA的親和力,這決定了基因的誘…

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論文資訊

  • 類型:已發表論文
  • 日期:2022-09-02

摘要

基因表現噪音不僅無所不在,而且變化多端,我們仍然不了解影響它的一些最基本的因素。其中包括轉錄因子 (TF) 在 DNA 上的停留時間,即與 DNA 結合的 TF 保持結合狀態的平均時間。在這裡,我們使用轉錄調控的隨機模型來研究停留時間如何影響 TF 誘導基因表現時產生的基因表現噪音。我們發現停留時間對基因表現噪音的影響取決於TF的濃度及其與DNA的親和力,這決定了基因的誘導程度。在高水平誘導下,停留時間對基因表現噪音沒有影響。然而,隨著誘導水平的降低,短暫停留時間會降低基因表現噪音。原因是快速開關 TF 結合動力學阻止了蛋白質主要合成或降解的長時間,這可能導致基因表現的過度波動。因此,短的停留時間可以幫助基因調控系統獲得有關其運作的細胞環境的資訊。我們的預測與觀察結果一致,即實驗測量的停留時間通常較短,介於幾秒到幾分鐘之間。