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論文資訊
- 類型:已發表論文
- 日期:2022-09-02
摘要
基於RNA的調控的重要性變得越來越明顯。全基因組定序工作表明,真核基因組中的大部分 DNA 都是轉錄的。用於全基因組檢測 RNA-蛋白質相互作用的 CLIP 等先進高通量技術表明,RNA 結合蛋白的轉錄後調控與轉錄調控的複雜性相符。由於對基於 RNA 的數據進行專門和綜合分析的需求,德國生物資訊基礎設施網絡 (de.NBI) 內成立了 RNA 生物資訊中心 (RBC)。本文介紹了 RBC 提供的工具、服務和資料庫,並展示了範例應用程式。此外,我們在 Galaxy 框架內建立了一個 RNA 工作台。為了方便傳播,我們提供了 Galaxy 的虛擬化版本(透過 Galaxy Docker),使其他小組能夠以非常簡單的方式使用我們的 RNA 工作台。