本頁只刊出中文翻譯與中文說明；英文原文請見下方原文連結。
原文連結
論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
基本的身體結構和主要生理軸在哺乳動物演化過程中高度保守，但人類基因組序列中只有一小部分似乎受到演化的限制。為了量化順式作用與反式作用對哺乳動物調控進化的貢獻，我們對 25 種細胞和組織類型的小鼠基因組進行了基因組 DNase I 足跡分析，以核苷酸分辨率共同定義了大約 860 萬個轉錄因子 (TF) 佔據位點。在這裡，我們展示了小鼠 TF 足跡聯合編碼的監管詞典，與人類 TF 足跡衍生的監管詞典相似度高達 95%。然而，只有約 20% 的小鼠 TF 足跡具有人類直系同源物。儘管順式調控格局發生了巨大的轉變，但透過 TF 識別序列的進化創新，連接小鼠 TF 基因的所有成對調控相互作用中近一半已在直系同源人類細胞類型中得以維持。此外，小鼠 TF 到 TF 連接到細胞網路架構的更高層級組織幾乎與人類相同。我們的結果表明，哺乳動物基因調控的演化選擇主要針對反式調控迴路水平，從而實現並增強順式調控可塑性。