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論文資訊
- 類型:已發表論文
- 日期:2022-09-02
摘要
大規模 RNA 定序揭示了大量不編碼蛋白質的長 mRNA 樣轉錄本 (lncRNA)。眾所周知,這些 lncRNA 的演化史很難系統性地研究,因為它們的序列保守程度較低,無法進行全面的基於同源性的調查,並使它們幾乎不可能比對。然而,越來越多的特殊情況已被證明至少與脊椎動物譜系一樣古老。在這裡,我們利用剪接位點的保守性來追蹤 lncRNA 的演化。我們發現,超過 85% 的人類 GENCODE lncRNA 已經存在於胎盤哺乳動物的分歧處,而數百個此類 RNA 的歷史可以追溯到更早的時期。儘管如此,我們觀察到內含子/外顯子結構的快速更新。我們得出的結論是,lncRNA 基因是脊椎動物基因組的進化古老組成部分,表現出意想不到的、前所未有的進化可塑性。我們提供公共網路服務(