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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
將新陳代謝作為分子相互作用網絡的系統級圖景的搜尋提供了一個範例，說明用於表徵系統的方法如何影響其功能意義的解釋。使用網路理論的新技術對代謝圖進行了分析，揭示了一些重要的、功能相關的特性。其中包括小世界結構和分層模組化。然而，正如這裡所討論的，其中一些屬性實際上可能是由定義網路互動的不適當方式造成的。從所謂的代謝二分組織開始，其中考慮了兩個有意義的子集（反應和代謝物），目前大多數工作透過所謂的圖形投影僅使用其中一個子集。不幸的是，投影圖常常忽略相關的生物和化學約束，導致統計假象。其中一些缺點和替代方法需要妥善解決。