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論文資訊
- 類型:已發表論文
- 日期:2022-09-02
摘要
將細胞視為生物工廠,我們的目標是透過使用當今大型工業正在實施的相同工程原理來優化其內部流程:精益製造。我們將逆向工程計算方法應用於從番茄重組近交系集合中獲得的轉錄組學、代謝組學和表型組學數據,以製定動力學和基於約束的模型,該模型有效地描述了最小核心基因表達的細胞代謝。根據預測的代謝特徵,以高統計可信度揭示了與成熟果實的農藝和感官特性的密切關聯。受合成生物學方法的啟發,該模型用於探索所有可能的局部轉錄變化的情況,目的是設計具有微調生物技術特性的番茄果實。該方法透過所提出的基因組的能力進行了驗證,該基因組是為修改所需的基因組而設計的!農藝性狀,以概括相關代謝物間的實驗相關性。