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論文資訊
- 類型:已發表論文
- 日期:2022-09-02
摘要
對 229 個小麥矮縮病毒 (WDV) 分離株的遺傳多樣性和重組模式進行了評估,這些病毒是重要的穀物感染雙生病毒。重組熱點集中在編碼複製蛋白(Rep)、外殼蛋白(cp)和運動蛋白(mp)的基因的邊界處,以及Rep和cp內部以及短基因間區域(SIR)。系統發育分析證實,全球WDV族群根據其特定宿主小麥和大麥分為兩類,兩類劃分的關鍵區域是mp和大基因間區域(LIR)。透過計算推斷的氨基酸殘基之間的協同進化模式和預測的病毒蛋白 3D 結構提供了菌株或物種之間在基因組和蛋白質水平上的進一步差異。 WDV 小麥特異性組中 Rep 和 Rep A 蛋白之間普遍存在的相互作用反映了它們在 WDV 複製和轉錄中的重要而複雜的功能。此外,WDV 小麥特異性組中 CP 和 Rep 以及 CP 和 Rep A 蛋白之間的顯著預測交互作用被認為對於病毒在感染過程中成功包殼和運動至關重要。