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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
對 HIV-1 序列進行了分析，以估計 HIV-1 主要菌株（導致愛滋病大流行的菌株）的祖先序列出現的時間。使用平行超級電腦並假設演化速率恆定，我們將最大似然系統發育方法應用於前所未有的大量資料進行計算。我們透過正確估計兩個歷史記錄點的時間來驗證我們的方法。使用全面的全長包膜序列比對，我們估計 HIV-1 主要群體的最後共同祖先的日期為 1931 年 (1915-41)。 gag 基因比對、包括附加序列的包膜子區域以及放寬嚴格分子鐘假設的方法的分析也支持了這些結果。