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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
對人類微生物組的比較分析已經確定了與多種疾病相關的分類和功能變化。然而，迄今為止，微生物組分類和功能大多是獨立研究的，功能失衡的分類驅動因素尚未系統確定。在這裡，我們提出了 FishTaco，一個分析和計算框架，它整合了分類學和功能比較分析，以準確量化分類單元層級對疾病相關功能轉變的貢獻。將 FishTaco 應用於幾個大規模的宏基因組隊列，我們發現微生物組功能的變化可以追溯到特定的分類單元。此外，驅動功能轉變的類群集合及其貢獻程度在功能之間存在顯著差異。我們也發現，不同疾病中類似的功能失衡是由疾病特異性和共享類群所驅動的。這種對微生物組生態和功能動態的綜合分析可以為未來基於微生物組的治療提供信息，確定操縱微生物組功能能力的假定乾預目標。