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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
對傳播的丙型肝炎病毒（HCV）基因組進行精確的分子鑑定可以闡明傳播生物學、免疫發病機制和自然史的關鍵方面。我們使用來自血漿病毒 RNA 的 2,922 個半或四分之一基因組的單基因組定序來識別 17 名急性社區獲得性 HCV 感染受試者的傳播/創始 (T/F) 病毒。來自 17 名急性受試者中的 13 名（但 14 名慢性對照受試者）的序列均未表現出一種或多種離散的低多樣性病毒譜系。每個譜系內的序列通常揭示了星狀突變系統發育，這些突變合併為明確的 T/F 病毒基因組。导致有效临床感染的传播病毒数量估计为 1 至 37 或更多（中位数 = 4）。四名急性感染受试者表现出明显不同的病毒多样性模式，偏离了星状系统发育。在这些情况下，实证分析和数学建模表明存在高度多重性 vi！ rus 传播自自身严重感染或因抗病毒药物治疗而经历病毒种群瓶颈的个体。這些結果為丙型肝炎病毒傳播提供了新的定量和定性見解，首次揭示了成功的疫苗或治療幹預措施需要克服的病毒與宿主之間的相互作用。我們的研究結果進一步提出了一種新的實驗策略，用於識別全長 T/F 基因組，用於 HCV 生物學的全蛋白質組分析以及抗病毒藥物或免疫壓力的適應。