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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
對粒線體基因組演化的全面理解需要詳細的粒線體基因組複製機製圖景。儘管之前做了許多努力，但確定複製起點並透過基因順序重排追蹤其命運仍然是一個不小的問題，即使在動物線粒體的小基因組中也是如此。我們在此詳細闡述了 GC 偏差與複製起點的距離相關的觀察結果。這種效應被解釋為粒線體 DNA 複製的標準模型（即鏈置換模型）的結果。根據該模型，化學損傷的累積與 DNA 在複製 (D-ssh) 期間以單鏈形式暴露的持續時間成正比，這取決於相對於複製起點的相對位置。基於該模型，我們開發了一種計算方法，可以從核苷酸傾斜數據推斷重鍊和輕鏈起源的位置。在對後口動物粒線體的全面調查中，我們推斷出絕大多數脊椎動物和頭索動物的保守複製起點。與共識圖景的偏差可能與基因組重排有關。