摘要 小非蛋白编码 RNA (ncRNA) 已在从大肠杆菌到智人的各种模式生物中进行了系统研究

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• 類型：已發表論文
• 日期：2022-09-02

摘要

小非蛋白编码 RNA (ncRNA) 已在从大肠杆菌到智人的各种模式生物中进行了系统研究。在这里，我们分析了致病性丝状真菌烟曲霉的小 ncRNA 转录组。為此，我們透過從大小選定的小 RNA 物種中生成專門的 cDNA 文庫，透過實驗篩選了在各種生長條件或特定發育階段中表達的 ncRNA。我們的篩選揭示了來自已知 ncRNA 類別的 30 種新型 ncRNA 候選物，例如小核 RNA (snRNA) 和 C/D 盒型小核仁 RNA (C/D 盒 snoRNA)。此外，可以通过生物信息学筛选来预测 H/ACA 盒 snoRNA 的几种候选者。我们还鉴定了 15 个 ncRNA 候选者，它们无法归属于任何已知的 ncRNA 类别。其中一些 ncRNA 物种受到发育调控，这意味着烟曲霉发育中可能具有新功能。令人驚訝的是，除了全長 tRNA 之外，我們還只鑑定了 5 或 3 半 tRNA，它們可能是由反密碼子環內的 tRNA 裂解產生的。我们发现分生孢子形成会诱导 tRNA 裂解，导致分生孢子内 tRNA 耗尽。由於分生孢子代表煙麴菌的靜止狀態，我們認為分生孢子 tRNA 消耗量可能是下調絲狀真菌中蛋白質合成的新機制。