聖塔非研究所

摘要 差異甲基化區域(DMR)的檢測是表徵不同表觀遺傳狀態的必要先決條件

2022-09-02 · 已發表論文 · 更新 2026/03/19 上午03:12

摘要 差異甲基化區域(DMR)的檢測是表徵不同表觀遺傳狀態的必要先決條件。我們提出了一個新的程序,metilene,以無與倫比的特異性和靈敏度來識別全基因組和目標數據中的 DMR。二进制分割算法与二维统计测试相结合,可以在几分钟内(而不是使用现成硬件需要几天的时间)在多组样本的大型甲基化实验中检测 DMR。對於低覆蓋率數據,metilene 的性能優於其他最先進的工具,並且可以…

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論文資訊

  • 類型:已發表論文
  • 日期:2022-09-02

摘要

差異甲基化區域(DMR)的檢測是表徵不同表觀遺傳狀態的必要先決條件。我們提出了一個新的程序,metilene,以無與倫比的特異性和靈敏度來識別全基因組和目標數據中的 DMR。二进制分割算法与二维统计测试相结合,可以在几分钟内(而不是使用现成硬件需要几天的时间)在多组样本的大型甲基化实验中检测 DMR。對於低覆蓋率數據,metilene 的性能優於其他最先進的工具,並且可以估計缺失的數據。因此,metilene 是一种多功能工具,可在全球全基因组水平上研究表观遗传修饰对分化/发育、肿瘤发生和系统生物学的影响。无论是在每组有数十个样本的国际联盟框架中,还是在没有生物复制的情况下,它都能产生非常重要和可靠的结果。