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論文資訊
- 類型:已發表論文
- 日期:2022-09-02
摘要
布朗克斯是美國 COVID-19 大流行的早期震央。我們從 2020 年 3 月至 10 月對整個布朗克斯區的 SARS-CoV-2 基因組進行了時間基因組監測。儘管 SARS-CoV-2 譜系的局部結構反映了紐約市和紐約州的結構,但時間採樣揭示了 SARS-CoV-2 基因組多樣性的動態和變化的情況。透過繪製變體的軌跡,我們發現,雖然有些變體已成為布朗克斯的“流行”,但其他新變體在夏末/初秋的流行率有所上升。地理分析的基因組使我們能夠區分再感染病例和持續感染病例。我們建議,有限的、有針對性的、時間性的基因組監測對於管理目前的新冠病毒大流行具有臨床和流行病學效用。