摘要 幽門螺旋桿菌的基因組定序揭示了這種流行的人類病原體的潛在蛋白質和遺傳多樣性，但對其轉錄組織和非編碼

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• 類型：已發表論文
• 日期：2022-09-02

摘要

幽門螺旋桿菌的基因組定序揭示了這種流行的人類病原體的潛在蛋白質和遺傳多樣性，但對其轉錄組織和非編碼 RNA 輸出知之甚少。大規模平行 cDNA 定序 (RNA-seq) 徹底改變了全球轉錄組分析。在這裡，我們使用一種選擇性初級轉錄物 5' 端的新型差異方法 (dRNA-seq)，展示了幽門螺旋桿菌轉錄起始位點和操縱子的全基因組圖譜。我們在操縱子內發現了數百個轉錄起始位點，與註釋基因相反，顯示小幽門螺旋桿菌基因組的基因表現複雜性透過多順反子的解偶聯和全基因組反義轉錄而增加。我們也發現了意想不到數量的類似 60 個小 RNA，包括調節 6S RNA 的 e-細分對應物和相關 RNA 產物，以及順式和反式編碼的目標信使 RNA 的潛在調節因子。我們的方法建立了繪製和註釋許多生物物種的主要轉錄組的範例。