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論文資訊
- 類型:已發表論文
- 日期:2022-09-02
摘要
我們提供了一套線上工具來設計候選疫苗蛋白,並使用 k-mers(作為潛在 T 細胞表位的代表)的覆蓋率作為指標來評估抗原潛力。疫苗設計工具使用最近發布的鑲嵌方法來產生針對高頻 k-mers 覆蓋進行優化的蛋白質序列;覆蓋率評估工具有助於對任何潛在抗原進行覆蓋率比較。為了展示這些工具,我們為 B 進化枝 HIV-1 Gag、Pol 和 Nef 設計了嵌合蛋白組,並將它們與最近的人類疫苗試驗中使用的抗原進行了比較。