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聖塔非研究所

摘要 我們提出了一個使用微衛星和單核苷酸多態性（SNP）等共顯性基因組標記在自然群體中進行譜系重建的軟體

2022-09-02 · 已發表論文 · 更新 2026/03/19 上午03:59

摘要 我們提出了一個使用微衛星和單核苷酸多態性（SNP）等共顯性基因組標記在自然群體中進行譜系重建的軟體包。如果可用，則演算法會利用先驗訊息，例如已知的關係（子譜系）或個體的年齡和性別。統計置信度透過馬可夫鏈蒙特卡羅 (MCMC) 取樣來估計。該演算法的準確性透過模擬數據以及具有已知譜系的經驗數據集得到證明。即使有基因分型錯誤，親子關係推論也是穩健的。

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論文資訊

  • 類型：已發表論文
  • 日期：2022-09-02

摘要

我們提出了一個使用微衛星和單核苷酸多態性（SNP）等共顯性基因組標記在自然群體中進行譜系重建的軟體包。如果可用，則演算法會利用先驗訊息，例如已知的關係（子譜系）或個體的年齡和性別。統計置信度透過馬可夫鏈蒙特卡羅 (MCMC) 取樣來估計。該演算法的準確性透過模擬數據以及具有已知譜系的經驗數據集得到證明。即使有基因分型錯誤，親子關係推論也是穩健的。