聖塔非研究所

摘要 我們提出了一種用於分析肽微陣列抗體結合數據的整合分析方法,從標準化到特定主題的積極性調用以及數據整

2022-09-02 · 已發表論文 · 更新 2026/03/19 上午03:34

摘要 我們提出了一種用於分析肽微陣列抗體結合數據的整合分析方法,從標準化到特定主題的積極性調用以及數據整合和視覺化。目前用於標準化此類數據集的技術並未考慮非特異性結合活性。一種基於勝肽序列資訊的新型歸一化技術快速有效地減少了系統偏差。我們也採用了滑動平均視窗技術,借用共享相似序列的勝肽的強度,從而減少訊號變異性。平滑訊號有助於檢測弱抗體結合熱點。設定陽性閾值的新原理 FDR 方…

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  • 類型:已發表論文
  • 日期:2022-09-02

摘要

我們提出了一種用於分析肽微陣列抗體結合數據的整合分析方法,從標準化到特定主題的積極性調用以及數據整合和視覺化。目前用於標準化此類數據集的技術並未考慮非特異性結合活性。一種基於勝肽序列資訊的新型歸一化技術快速有效地減少了系統偏差。我們也採用了滑動平均視窗技術,借用共享相似序列的勝肽的強度,從而減少訊號變異性。平滑訊號有助於檢測弱抗體結合熱點。設定陽性閾值的新原理 FDR 方法在敏感性和特異性之間取得了平衡。此外,我們也展示了在進行特定主題的積極性評估時使用基線控制測量的實用性和重要性。來自候選 HIV-1 疫苗的兩項人體臨床試驗的數據集用於驗證我們整體計算框架的有效性。