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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
我們提出了一種貝葉斯方法，使用微衛星和單核苷酸多態性 (SNP) 等共顯性基因組標記來重建克隆群體中的譜系。透過模擬數據證明了該演算法的準確性。我們表明，即使使用中等功率的標記組，也可以高精度地聯合估計感興趣的參數（例如自體受精率）。在這種情況下，經典方法只能分配非常有限數量的具有統計意義的親子關係，因此會失敗。統計置信度透過馬可夫鏈蒙特卡羅 (MCMC) 取樣來估計。該方法是在快速且易於使用的開源軟體中實現的，該軟體可擴展到包含數千人的大型資料集。