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論文資訊
- 類型：已發表論文
- 日期：2022-09-02
摘要
我們研究了基因調控網絡演化的簡化模型，其中透過基於網絡節點（基因）的結構和動態特徵的各種選擇規則來添加連結（調控交互作用）。與經過充分研究的「爆炸性」滲透模型類似，在我們的方法中，選擇性地添加鏈接，以延遲向大規模損傷傳播的過渡，即使網絡對基因狀態的小擾動具有魯棒性。我們發現，當選擇只取決於結構時，即使不了解個體基因「受損」的傾向，演化的網絡也能抵抗廣泛的損害傳播。我們也觀察到，為避免損傷傳播而演化的網絡傾向於不協調（即有向連結優先將高度「源」基因連接到低度「目標」基因，反之亦然）。我們將我們的模擬與幾個不同物種的重建基因調控網絡進行比較，其中基因和連結在進化過程中添加，我們發現重建網絡中存在類似的不協調性偏差。