本頁只刊出中文翻譯與中文說明;英文原文請見下方原文連結。
原文連結
論文資訊
- 類型:已發表論文
- 日期:2022-09-02
摘要
我們透過將影響每個表型的基因型表示為基因型網絡,研究了模式植物擬南芥中 80 個定量表型的基因型-表型圖譜。在這樣的網絡中,每個頂點或節點對應於個體在影響給定表型的所有基因組位點上的基因型。如果相關基因型恰好在一個核苷酸上不同,則兩個頂點透過一條邊連接。我們分析的 80 個基因型網絡是基於 199A.thaliana 種質的全基因組關聯研究的數據。它們形成連通圖,其拓撲在表型之間有很大差異。我們將分析重點放在上位性(突變之間的非加性交互作用)的發生率上,因為上位性的高發生率會降低向高或低表型值進化路徑的可及性。我們在 67 個表型中發現了上位相互作用,並且在 51 個表型中,每個成對突變體相互作用都是上位的。此外,我們發現達到最大表型值的可接近突變路徑的比例存在表型特異性差異。然而,即使上位性影響最大表型值的可及性,我們分析的表型的基因型和表型變化之間的關係足夠平滑,即使上位性普遍存在,某些進化路徑對於大多數表型來說仍然是可訪問的。我們使用的基因型網絡表示可以補充現有的方法,以了解許多不同生物體中多基因性狀的遺傳結構。